Rice evoluciona una Cas9 compacta para alcanzar genes del corazón

Investigadores de Rice University usaron una plataforma de evolución de proteínas asistida por inteligencia artificial, llamada Sequence Display, para crear nuevas variantes de una enzima CRISPR compacta, la SlugCas9, capaces de editar tramos de ADN antes difíciles de alcanzar. El trabajo se publicó en Nature Communications y se divulgó el 4 de noviembre de 2026.

El obstáculo estaba en los PAM, secuencias cortas de ADN que funcionan como punto de anclaje de la enzima Cas9. Sin reconocer un PAM adecuado, la enzima no puede editar con precisión el tramo vecino. La SlugCas9, una Cas9 compacta y popular, reconocía cuatro PAM de interés solo de forma débil: se deslizaba o no lograba unirse a ellos.

Con Sequence Display, el equipo generó grandes conjuntos de datos de secuencia y actividad, que la IA usó para identificar las secuencias de proteína más prometedoras para cada función. Según los investigadores, se encontraron candidatos prometedores en una semana, un ritmo que contrasta con intentos anteriores, que tuvieron poco éxito al intentar evolucionar otras variantes de Cas9 para esos mismos PAM.

En la prueba de concepto, las variantes evolucionadas editaron, en células cultivadas en laboratorio, sitios en los genes APOC3 y PCSK9, asociados al riesgo de enfermedad coronaria. Las ediciones introdujeron cambios genéticos potencialmente protectores, ligados a un menor riesgo, pero el límite es fundamental: el resultado se demostró en células cultivadas, no en personas, y no se trata de un tratamiento disponible.

El valor más amplio, según el autor correspondiente Han Xiao, está en el método: evolucionar rápidamente enzimas Cas9 (y otras proteínas) a medida para requisitos técnicos complejos, en lugar de depender de una única enzima genérica. El estudio aborda PAM difíciles de la familia NNAN y subraya que las enzimas compactas son más fáciles de entregar, pero reconocen pocos objetivos, exactamente el cuello de botella que el nuevo trabajo intenta aflojar.

Crédito de la imagen: imagen ilustrativa de la estructura de Cas9, vía Wikimedia Commons.

Fuentes: MedicalXpress / Rice University (4 de noviembre de 2026); Nature Communications, Cheng et al. (publicado el 30 de octubre de 2026).

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Firma: Muse